36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2312 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2312  cytochrome c, class I  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0109584  hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4148  cytochrome c class I  33.16 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.37393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4516  cytochrome c class I  33.16 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0581555  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0781  cytochrome c family protein  34.03 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1909  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  32.3 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2995  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00916007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4630  cytochrome c class I  35.66 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4208  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0400385  normal  0.12753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2042  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0473  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8038  cytochrome c class I  31.9 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.29 
 
 		 382 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.25 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.62 
 
 		 317 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1992  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.03 
 
 		 323 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  26.09 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6353  cytochrome c class I  26.8 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5825  hypothetical protein  31.33 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 313 aa  44.3  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  34.29 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.63 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1450  cytochrome c, class I  27.17 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 346 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  31.25 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.7 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.7 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02058  Cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.43 
 
 		 113 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00379379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  37.88 
 
 		 324 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.7 
 
 		 321 aa  41.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.81 
 
 		 298 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  27.71 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>