40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3043 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  39.66 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  50 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  36.84 
 
 
115 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  47.62 
 
 
97 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  35.4 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  41.18 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  40.45 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  36.79 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  38.68 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  39.76 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  34.94 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.06 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  38.46 
 
 
247 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  33.33 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  38.46 
 
 
256 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  32.94 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  35.06 
 
 
215 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  28.93 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.56 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  39.51 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  29.91 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  35 
 
 
210 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  37.18 
 
 
210 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  35 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  31.96 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  31.17 
 
 
220 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  32.47 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  28.18 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  27.27 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  43.04 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  30.26 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  30.83 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  29.09 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  29.87 
 
 
220 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  30.26 
 
 
213 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.51 
 
 
307 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>