29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1909 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 
150 aa  313  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  81.6 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  42.5 
 
 
158 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  38.14 
 
 
138 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  34.75 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  42.11 
 
 
180 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  39.47 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  41.32 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  33.33 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  35.2 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  33.08 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  32.81 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  36 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  32.32 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  29.25 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  27 
 
 
126 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  37.29 
 
 
174 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  30.3 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.14 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  30.77 
 
 
484 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.77 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  28.33 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  29.29 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  26.5 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  34.29 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  27.27 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  32.65 
 
 
155 aa  40  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>