62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5240 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  100 
 
 		 140 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5829  putative cytochrome c protein, class I  60.34 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2986  hypothetical protein  53.85 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.0850747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2352  hypothetical protein  54.37 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0092  hypothetical protein  56.38 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  38.73 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  41.73 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1994  putative cytochrome c  45.98 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0572463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 293 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  45.33 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.12 
 
 		 354 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  42.67 
 
 		 434 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  42.67 
 
 		 354 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  42.67 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  44 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 353 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  36.45 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  37.65 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.59 
 
 		 371 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  39.53 
 
 		 352 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  33.1 
 
 		 330 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  37.78 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 381 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  38.67 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 318 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  40 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 346 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 		 342 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  39.29 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 		 346 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  39.02 
 
 		 327 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  33.79 
 
 		 324 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  39.29 
 
 		 324 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  35.37 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  22.76 
 
 		 969 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 351 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 238 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 356 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 238 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.23 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  24.11 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>