21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1738 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  100 
 
 		 112 aa  235  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  46.74 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  32.76 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  30.43 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  27.68 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  27.93 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  25.25 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  26.97 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  31.87 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  25.58 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  26.67 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.65 
 
 		 400 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>