22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0563 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  8e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  41.45 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  55.1 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  51.92 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  41.55 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  50 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  48.54 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  48.41 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  54.17 
 
 		 139 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  44.34 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  42.11 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  43.7 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  48.98 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  50 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  48.91 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  49.45 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  46.67 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  47.31 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  28.89 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  26.67 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  25.26 
 
 		 111 aa  44.7  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>