16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0396 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  100 
 
 		 102 aa  216  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  46.74 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  31.46 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  28.09 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  30 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  32.97 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  30 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  26.97 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  30 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  31.87 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  26.97 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  24.72 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  25.84 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>