25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0451 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  100 
 
 
132 aa  277  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  51.89 
 
 
165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  50.46 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  50.49 
 
 
162 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  48.54 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  43.2 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  50 
 
 
136 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  44.83 
 
 
139 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  42.02 
 
 
138 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  46.53 
 
 
139 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  52.58 
 
 
167 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  43.75 
 
 
134 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  41.46 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  43.43 
 
 
176 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  49.45 
 
 
138 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  51.55 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  45.74 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  34.45 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  27.93 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  31.87 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
337 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  25.23 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  24.79 
 
 
262 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>