22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0268 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  100 
 
 
162 aa  336  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  51.68 
 
 
165 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  50.49 
 
 
132 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  38.98 
 
 
176 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  56.04 
 
 
138 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  53.26 
 
 
136 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  46.15 
 
 
167 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  46.23 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  52.69 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  42.86 
 
 
139 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  46.94 
 
 
134 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  42 
 
 
139 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  43.56 
 
 
132 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  43.56 
 
 
139 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  43 
 
 
139 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  42.31 
 
 
139 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  38.83 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  43.4 
 
 
143 aa  94  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  33.67 
 
 
112 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  30 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  31.11 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1329  hypothetical protein  22.58 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0345562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>