20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1269 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  57.63 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  52.46 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  49.25 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  57.28 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  53.98 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  54.24 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  54.74 
 
 		 134 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  55.24 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  44.2 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  49.46 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  43 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  39.09 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  35.48 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  34.45 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  43.82 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  43.7 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  26.97 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  24.72 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>