21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1538 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  100 
 
 		 131 aa  273  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  50.46 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  44.72 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  42.15 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  42.02 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  40 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  39.66 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  34.11 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  37.98 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  37.82 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  48.98 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  34.78 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  41.24 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  34.34 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>