20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0303 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  38.98 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 139 aa  107  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  41.38 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  46.39 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  41.35 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  43.3 
 
 		 134 aa  99  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  46.81 
 
 		 136 aa  98.2  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 139 aa  97.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  47.25 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  41.82 
 
 		 136 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  41.49 
 
 		 139 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  34.26 
 
 		 131 aa  87.4  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  45.36 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  25.26 
 
 		 112 aa  48.9  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1329  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0345562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>