24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0171 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  59.69 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  52.14 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  63.03 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  53.39 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  50.38 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  59 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  52.85 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  48.76 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  56.52 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  51.2 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  44.04 
 
 		 165 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  42.02 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  40.17 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  50.57 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  41.76 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  43.14 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  32.76 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  29.35 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  27.78 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  25.93 
 
 		 162 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>