21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1477 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  100 
 
 		 139 aa  290  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  60.87 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  52.14 
 
 		 139 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  56.67 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  57.5 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  61.17 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  59.79 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  50.39 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  52.1 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  49.14 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  44.83 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  40.37 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  44.68 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  38.14 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  47.71 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  46.55 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  41.11 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  30.43 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  25.84 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>