21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1537 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  100 
 
 		 132 aa  276  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  45.08 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  47.27 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  46.09 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  49 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  40.83 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  40.98 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  44 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  41.67 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  41.32 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  42.27 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  42.57 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  49 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  36.52 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  41.11 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1329  hypothetical protein  29.91 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0345562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  25.53 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  29.81 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>