13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3109 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  100 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  72.5 
 
 
160 aa  246  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  72.5 
 
 
160 aa  246  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  49.08 
 
 
163 aa  176  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  49.69 
 
 
163 aa  173  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  46.01 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  47.97 
 
 
215 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  44.72 
 
 
161 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  44.06 
 
 
170 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  40.49 
 
 
186 aa  131  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  43.62 
 
 
170 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  37.5 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  28.22 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>