21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1289 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  100 
 
 		 139 aa  290  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  74.82 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  74.1 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  59.02 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  56.67 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  56.64 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  55.74 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  60.38 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  53.98 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  52.69 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  51.92 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  40 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  46.53 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  45.74 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  42.55 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  47.47 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  32.04 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  30.34 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 		 371 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>