22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0434 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  100 
 
 
139 aa  289  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  74.1 
 
 
139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  66.19 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  52.86 
 
 
136 aa  147  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  54.2 
 
 
139 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  60.2 
 
 
139 aa  140  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  60 
 
 
136 aa  137  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  57.84 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  53.98 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  56.99 
 
 
138 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  42.5 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  37.01 
 
 
165 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  42 
 
 
162 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  44.35 
 
 
143 aa  103  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  36.89 
 
 
132 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  41.46 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  44.44 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  31.68 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  28.09 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  39.02 
 
 
350 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  25.27 
 
 
111 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>