26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2327 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  100 
 
 		 136 aa  284  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  61.21 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  56.41 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  53.62 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  50 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  52.89 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  51.26 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  62.5 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  52 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  51.26 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  44.26 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  41.18 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  41.32 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  46.15 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  48.48 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  41.88 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  33.33 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  27.78 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  29.35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 327 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  30 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>