12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0095 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  227  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1367  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0296789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  29.31 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  34.44 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  31.58 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  31.11 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  29.07 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  26.67 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  29.35 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  29.67 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  21.77 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  25.27 
 
 
139 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>