21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1123 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  100 
 
 		 139 aa  290  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  74.82 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  66.19 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  55.73 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  61.17 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  58.18 
 
 		 134 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  60 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  55.66 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  51.06 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  46.09 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  44.17 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  43.56 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  54.17 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  45.74 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  41.6 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  29.41 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  26.97 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>