68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0756 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  100 
 
 		 541 aa  1097    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.68 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.12 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.91 
 
 		 522 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.61 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  25.15 
 
 		 742 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.75 
 
 		 1343 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.45 
 
 		 1148 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.72 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1224 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  24.74 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.14 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.47 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.82 
 
 		 958 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  24.23 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 1438 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.22 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 		 593 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.16 
 
 		 753 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.09 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.53 
 
 		 1133 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.78 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.06 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  22.27 
 
 		 719 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1181 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.9 
 
 		 1412 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.8 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.5 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.88 
 
 		 323 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  27.98 
 
 		 1194 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  25 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.38 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1234 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.83 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.19 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.16 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.78 
 
 		 959 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 		 670 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  23.27 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  20.78 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.32 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 		 641 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.46 
 
 		 1216 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  26.51 
 
 		 320 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.36 
 
 		 180 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79203  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  33.62 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.89 
 
 		 831 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.7 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.81 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.61 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  23.9 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.58 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  26.92 
 
 		 886 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.61 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.14 
 
 		 824 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  27.34 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 515 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  22.59 
 
 		 1328 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.17 
 
 		 1041 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 		 515 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>