116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3274 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  65.85 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  61.86 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.06 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  57.87 
 
 		 178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  56.69 
 
 		 168 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  40.44 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.08 
 
 		 1343 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.12 
 
 		 1148 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1094 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.62 
 
 		 958 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.69 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1224 aa  68.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  32.3 
 
 		 959 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.71 
 
 		 641 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.28 
 
 		 546 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1181 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.66 
 
 		 399 aa  65.1  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.68 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.19 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.18 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.9 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.68 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.61 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.11 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.55 
 
 		 644 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.16 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.12 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.76 
 
 		 642 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.8 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.78 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.68 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  31.86 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.69 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.16 
 
 		 886 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.14 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.68 
 
 		 524 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.69 
 
 		 492 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.17 
 
 		 493 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.44 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  26.4 
 
 		 643 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.64 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.33 
 
 		 666 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.28 
 
 		 1438 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.42 
 
 		 670 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  27.45 
 
 		 517 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.6 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  26.86 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.38 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.73 
 
 		 320 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.35 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.61 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  26.61 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 831 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.45 
 
 		 838 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.89 
 
 		 1328 aa  48.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.46 
 
 		 321 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.07 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.82 
 
 		 642 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.87 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  28.72 
 
 		 1141 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.41 
 
 		 431 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  33.7 
 
 		 541 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  32.2 
 
 		 1110 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.79 
 
 		 1412 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  23.16 
 
 		 316 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  35.38 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.63 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.32 
 
 		 1216 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.56 
 
 		 667 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 		 388 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.5 
 
 		 309 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  23.12 
 
 		 316 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.35 
 
 		 668 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3051  HEAT domain containing protein  30 
 
 		 304 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.593239  hitchhiker  0.000276879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  33.58 
 
 		 374 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  26.67 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.44 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.88 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.7 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.58 
 
 		 1194 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  34.68 
 
 		 1133 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  30.77 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  24.64 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.41 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  28.12 
 
 		 773 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.46 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  30.83 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>