45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5727 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  47.93 
 
 
219 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.2 
 
 
234 aa  204  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  48.39 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.09 
 
 
221 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.47 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0166  hypothetical protein  34.09 
 
 
203 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 
223 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.92 
 
 
226 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0122  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.22 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.29 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.29 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.03 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  26.63 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.64 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.24 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.24 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.1 
 
 
1148 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  37.5 
 
 
1224 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25 
 
 
1094 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.04 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.41 
 
 
1328 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.19 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.11 
 
 
667 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.7 
 
 
370 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  26.61 
 
 
319 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.11 
 
 
666 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  25.66 
 
 
1133 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  33.78 
 
 
254 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.93 
 
 
395 aa  45.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  26.73 
 
 
269 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  23.9 
 
 
958 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04441  hypothetical protein  27.14 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.38 
 
 
1139 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
857 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
857 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
1041 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  24.86 
 
 
319 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  23.5 
 
 
321 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  28.4 
 
 
773 aa  41.6  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>