38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2325 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.71 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  44.19 
 
 		 219 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  47.22 
 
 		 221 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.83 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  40.47 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0122  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0166  hypothetical protein  37.56 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.94 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.12 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.13 
 
 		 226 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.18 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.94 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.3 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28.5 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.76 
 
 		 493 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.82 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 593 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  34.45 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.25 
 
 		 1133 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.93 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.96 
 
 		 1148 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.55 
 
 		 1438 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.4 
 
 		 1328 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 1343 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  32.39 
 
 		 2216 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.66 
 
 		 1412 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>