49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0980 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.91 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.7 
 
 
203 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.02 
 
 
208 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1897  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  30 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  23.58 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22361  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  25.82 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.72 
 
 
399 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
334 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.99 
 
 
1412 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.19 
 
 
493 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.47 
 
 
1148 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.36 
 
 
1041 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.29 
 
 
666 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.27 
 
 
1094 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.63 
 
 
501 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.52 
 
 
510 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03341  hypothetical protein  26.29 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.25639  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.56 
 
 
670 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  29.25 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.48 
 
 
958 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.47 
 
 
390 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 
831 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.33 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  26.71 
 
 
646 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.24 
 
 
668 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.03 
 
 
1328 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.85 
 
 
667 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.7 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.12 
 
 
546 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.74 
 
 
1343 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.39 
 
 
524 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 
395 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.45 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  36.49 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.09 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.54 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.43 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.47 
 
 
646 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  27.68 
 
 
315 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.38 
 
 
298 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  28.1 
 
 
1133 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.47 
 
 
490 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.67 
 
 
431 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.55 
 
 
641 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  28.07 
 
 
299 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.34 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.94 
 
 
1139 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.89 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>