31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1897 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1897  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  43.14 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22361  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  36.56 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0995  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.5 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.87 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.68 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03871  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  27.27 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215926  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1673  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  27.27 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03341  hypothetical protein  28.06 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.25639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  28.26 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.97 
 
 		 1328 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  27.17 
 
 		 319 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.65 
 
 		 1148 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.25 
 
 		 370 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  28.8 
 
 		 323 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 		 1343 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.25 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.86 
 
 		 644 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.55 
 
 		 408 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.04 
 
 		 490 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.53 
 
 		 313 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  24.89 
 
 		 838 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.72 
 
 		 1041 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.35 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.93 
 
 		 493 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  38.57 
 
 		 697 aa  42  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.86 
 
 		 642 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  24.73 
 
 		 299 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>