30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0119 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  100 
 
 		 1075 aa  2165    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.65 
 
 		 1239 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.91 
 
 		 942 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.45 
 
 		 1349 aa  65.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.25 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.33 
 
 		 1004 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.97 
 
 		 798 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.35 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.86 
 
 		 766 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1117 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.26 
 
 		 1237 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  30.2 
 
 		 1345 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  30.72 
 
 		 1742 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  32.03 
 
 		 1339 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.95 
 
 		 725 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.5 
 
 		 649 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.01 
 
 		 762 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  33.59 
 
 		 1150 aa  52.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.79 
 
 		 951 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.01 
 
 		 762 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.91 
 
 		 2194 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  29.01 
 
 		 773 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.74 
 
 		 570 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.16 
 
 		 799 aa  48.5  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.1 
 
 		 944 aa  48.5  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.17 
 
 		 1475 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.28 
 
 		 951 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.83 
 
 		 1216 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.87 
 
 		 801 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23 
 
 		 888 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>