17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2655 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  38.86 
 
 
1007 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  44.03 
 
 
174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  32.27 
 
 
1064 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  35.39 
 
 
1049 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  35.23 
 
 
1049 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.16 
 
 
1023 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  29.57 
 
 
1053 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  34.72 
 
 
395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.41 
 
 
514 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2254  hypothetical protein  33.72 
 
 
560 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  26.54 
 
 
992 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  27.7 
 
 
1194 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
809 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  32.56 
 
 
251 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1708  hypothetical protein  31.96 
 
 
372 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0162  hypothetical protein  25.24 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>