16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1037 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  359  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  55.75 
 
 
1007 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.12 
 
 
1023 aa  175  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  49.11 
 
 
1064 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  47.43 
 
 
1049 aa  157  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  48.5 
 
 
1053 aa  147  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  44.03 
 
 
278 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  43.37 
 
 
1049 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  33.93 
 
 
395 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2219  hypothetical protein  69.77 
 
 
55 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 
372 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25.79 
 
 
514 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
809 aa  52  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  24.24 
 
 
684 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  27.69 
 
 
992 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  28.71 
 
 
1194 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>