53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3373 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 992 aa  1973    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  47.45 
 
 		 514 aa  151  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  38.05 
 
 		 1194 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  30.79 
 
 		 399 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  31.32 
 
 		 1438 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.41 
 
 		 1454 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.57 
 
 		 969 aa  65.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  33.07 
 
 		 1243 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  27.51 
 
 		 919 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  27.46 
 
 		 934 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  31.22 
 
 		 1144 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.33 
 
 		 1027 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  26.54 
 
 		 278 aa  57  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  28.29 
 
 		 908 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 		 1053 aa  56.2  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  28.51 
 
 		 916 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.36 
 
 		 783 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  27.63 
 
 		 1088 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  28.79 
 
 		 715 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.11 
 
 		 992 aa  53.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 		 1003 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  30.03 
 
 		 978 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.19 
 
 		 822 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  28.27 
 
 		 970 aa  51.6  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  25.73 
 
 		 967 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 		 1108 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  28.48 
 
 		 989 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  24.54 
 
 		 834 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.89 
 
 		 1523 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.24 
 
 		 775 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  27.69 
 
 		 174 aa  48.9  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.58 
 
 		 1023 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 950 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 755 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1869 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  27.23 
 
 		 992 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  32.06 
 
 		 1049 aa  48.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  26.22 
 
 		 770 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 1502 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1427 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.23 
 
 		 921 aa  47.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.86 
 
 		 1003 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  26.82 
 
 		 946 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  27.61 
 
 		 1008 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  24.05 
 
 		 993 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  28.8 
 
 		 790 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  30.34 
 
 		 690 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  27.45 
 
 		 930 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.81 
 
 		 1484 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  28.16 
 
 		 675 aa  44.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 1022 aa  44.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>