149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4989 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  100 
 
 		 1243 aa  2430    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  46.1 
 
 		 1144 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6109  hypothetical protein  43.18 
 
 		 1567 aa  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3253  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1492 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94955  hitchhiker  0.000665346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  35.66 
 
 		 399 aa  132  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  29.2 
 
 		 969 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  24.62 
 
 		 1438 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.63 
 
 		 1523 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.48 
 
 		 1454 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.6 
 
 		 1280 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 954 aa  85.1  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 940 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5170  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1513 aa  82.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 		 990 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.88 
 
 		 1484 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.79 
 
 		 1010 aa  79.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.93 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 1022 aa  78.2  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  28.43 
 
 		 919 aa  77.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.08 
 
 		 1030 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 990 aa  75.1  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2958  hypothetical protein  31.88 
 
 		 456 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0140305  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 1088 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.22 
 
 		 913 aa  73.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  27.8 
 
 		 1008 aa  73.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1003 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.12 
 
 		 1003 aa  73.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  27.48 
 
 		 992 aa  72.4  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 970 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.73 
 
 		 783 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0354  hypothetical protein  30.83 
 
 		 142 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  28.46 
 
 		 1014 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 971 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.63 
 
 		 1027 aa  69.7  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 		 962 aa  68.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 		 1108 aa  68.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  26.28 
 
 		 995 aa  68.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 910 aa  68.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.03 
 
 		 1013 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 612 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 621 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1450 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 850 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 993 aa  66.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 978 aa  66.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.85 
 
 		 822 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 915 aa  65.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  26.59 
 
 		 1003 aa  65.1  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 1021 aa  65.1  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5126  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1531 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  25.91 
 
 		 1497 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 989 aa  64.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.17 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 982 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.86 
 
 		 992 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  33.07 
 
 		 992 aa  62.4  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  29.6 
 
 		 1025 aa  62.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 1048 aa  62.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 1319 aa  62  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.65 
 
 		 1017 aa  62  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  29.3 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 		 928 aa  61.6  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.38 
 
 		 1054 aa  61.6  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.34 
 
 		 921 aa  61.6  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  27.14 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1523 aa  60.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  25.7 
 
 		 964 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 941 aa  60.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.63 
 
 		 981 aa  60.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1212 aa  59.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  29.17 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 1071 aa  58.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  27.69 
 
 		 1138 aa  58.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  26.7 
 
 		 981 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  27.5 
 
 		 926 aa  58.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  27.47 
 
 		 838 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.57 
 
 		 672 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  34.48 
 
 		 1427 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  28.01 
 
 		 810 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 775 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.17 
 
 		 828 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  31.33 
 
 		 845 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 		 931 aa  56.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  26.42 
 
 		 1001 aa  56.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 967 aa  55.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 1030 aa  55.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 654 aa  55.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  29.94 
 
 		 788 aa  54.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3149  ATPase-like  28.27 
 
 		 531 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0173  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000559981  hitchhiker  0.0000526523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 956 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.89 
 
 		 937 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0017  gp140  22.81 
 
 		 688 aa  53.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0603615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 767 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>