185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3131 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 399 aa  799    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  29.92 
 
 		 1144 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  32.7 
 
 		 1243 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  30.79 
 
 		 992 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.17 
 
 		 969 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  29.69 
 
 		 797 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 1088 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.53 
 
 		 990 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1108 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.35 
 
 		 930 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  27.3 
 
 		 913 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  28.53 
 
 		 995 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.82 
 
 		 1280 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 1027 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 907 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.71 
 
 		 1014 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  24.84 
 
 		 1438 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1502 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 1008 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 1024 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 934 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  29.71 
 
 		 1138 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 1030 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 971 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.92 
 
 		 1454 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 		 1025 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.34 
 
 		 993 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  28.61 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 1003 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 992 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 1071 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 1022 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 1013 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 941 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 1003 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.51 
 
 		 1010 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.64 
 
 		 946 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 755 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.2 
 
 		 1523 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1001 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  31.9 
 
 		 838 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 1004 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 1020 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 654 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.28 
 
 		 921 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 940 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  28.29 
 
 		 931 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 612 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  26.45 
 
 		 1011 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 962 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  32.9 
 
 		 1484 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 1021 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 993 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 1048 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.08 
 
 		 981 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  27.68 
 
 		 908 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  27.13 
 
 		 981 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 850 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 983 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1427 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  28.53 
 
 		 915 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1869 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  26.16 
 
 		 1033 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.37 
 
 		 775 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  25.95 
 
 		 996 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  27.73 
 
 		 919 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 965 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  28.32 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  27.14 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 632 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  29.65 
 
 		 811 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 		 992 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.89 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 757 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.64 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  28.61 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.18 
 
 		 783 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  30.22 
 
 		 978 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  25.84 
 
 		 935 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.36 
 
 		 954 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  28.1 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  29.29 
 
 		 854 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1000 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  26.59 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  30.36 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 970 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 921 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  27.09 
 
 		 1060 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  27.21 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 857 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.85 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 928 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 989 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.56 
 
 		 990 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>