14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1708 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  770    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 809 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  30.68 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0162  hypothetical protein  30.77 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  26.54 
 
 		 684 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.7 
 
 		 1023 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  34.15 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 1049 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  28.28 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  31.96 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2254  hypothetical protein  23.28 
 
 		 560 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 1053 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  31.96 
 
 		 1007 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>