More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0064 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  51.52 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  50.85 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  50.51 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  50.51 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  50.51 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  35.18 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  33.86 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  33.08 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  29.91 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 621 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  28.33 
 
 		 957 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  34.25 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 861 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  35.35 
 
 		 570 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  30.65 
 
 		 781 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  27.86 
 
 		 497 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  33.64 
 
 		 535 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.27 
 
 		 820 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 		 618 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 1818 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  28.14 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1911 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  29.84 
 
 		 852 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  29.96 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 616 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  29.7 
 
 		 892 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 593 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 882 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  40.94 
 
 		 1392 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  33.78 
 
 		 523 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  28.63 
 
 		 603 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.24 
 
 		 586 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 625 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.82 
 
 		 781 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  29.27 
 
 		 522 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 		 611 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.71 
 
 		 468 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.93 
 
 		 444 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 621 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  29.26 
 
 		 664 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.22 
 
 		 742 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.82 
 
 		 929 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 654 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  34.21 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  29.92 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  31.62 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  29.04 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.05 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  29.44 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.8 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.03 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.86 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 637 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 698 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  30.43 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  29.7 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  27.08 
 
 		 1007 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  27.11 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 639 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  25.78 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1196 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 639 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  35.81 
 
 		 1049 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  29.33 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  25.75 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  26.74 
 
 		 620 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  28.28 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.56 
 
 		 616 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  26.65 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  25.29 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  29.29 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  25.82 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  29.57 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  28.3 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  29.72 
 
 		 1132 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.44 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.05 
 
 		 826 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1581 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  28.14 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>