18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2095 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  784    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  23.73 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  23.64 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  29.92 
 
 
598 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  35.44 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  27.48 
 
 
265 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  27.91 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  25.95 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  34.75 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  25.14 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.72 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  23.9 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  24.48 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  21.89 
 
 
231 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  21.89 
 
 
231 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  25 
 
 
261 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  27.97 
 
 
270 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.11 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>