28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2638 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1360    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  42.58 
 
 
539 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  41.74 
 
 
754 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 
897 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 
986 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  25.08 
 
 
1131 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08530  TIR-like domain-containing protein (DUF1863)  36.22 
 
 
875 aa  92.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  21.37 
 
 
1102 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  24.19 
 
 
1124 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  23.62 
 
 
1089 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  23.62 
 
 
1089 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.57 
 
 
1063 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  23.6 
 
 
1074 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  22.4 
 
 
1075 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  22.27 
 
 
1075 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  22.8 
 
 
1080 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  23.23 
 
 
1075 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  21.6 
 
 
1067 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  22.43 
 
 
1092 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  22.3 
 
 
1092 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.08 
 
 
919 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  36.73 
 
 
958 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.32 
 
 
924 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 
719 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1082 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  24.62 
 
 
973 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.19 
 
 
943 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>