18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1674 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1462    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  42.2 
 
 		 539 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  36.26 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 897 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1082 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1087 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.62 
 
 		 919 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08530  TIR-like domain-containing protein (DUF1863)  32.28 
 
 		 875 aa  69.7  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.72 
 
 		 1611 aa  54.3  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  34.95 
 
 		 958 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.33 
 
 		 924 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  32.2 
 
 		 1914 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  30.28 
 
 		 973 aa  52  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.5 
 
 		 943 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 1714 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 924 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.45 
 
 		 2145 aa  45.8  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>