79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5674 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 973 aa  1910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.06 
 
 		 924 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.26 
 
 		 919 aa  176  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.05 
 
 		 943 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 		 719 aa  102  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  41.75 
 
 		 958 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.53 
 
 		 1901 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 1221 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.48 
 
 		 1364 aa  67.8  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.66 
 
 		 1076 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.23 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.72 
 
 		 1164 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.31 
 
 		 1363 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.85 
 
 		 1831 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.8 
 
 		 1072 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.61 
 
 		 1072 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08530  TIR-like domain-containing protein (DUF1863)  29.85 
 
 		 875 aa  58.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563918 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 		 1878 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.46 
 
 		 1652 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.94 
 
 		 742 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1807 aa  55.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 		 696 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.93 
 
 		 1711 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.18 
 
 		 698 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  29.75 
 
 		 754 aa  54.7  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.15 
 
 		 1236 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  19.63 
 
 		 1247 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.08 
 
 		 692 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.69 
 
 		 1193 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.37 
 
 		 464 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  24.95 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  28.14 
 
 		 539 aa  52  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20.45 
 
 		 1163 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.48 
 
 		 1686 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.3 
 
 		 1217 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 		 1208 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 		 947 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.58 
 
 		 664 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.71 
 
 		 1583 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.37 
 
 		 1348 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.33 
 
 		 1823 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1214 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.52 
 
 		 1609 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.51 
 
 		 740 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.12 
 
 		 1523 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.5 
 
 		 443 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1491 aa  48.5  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.77 
 
 		 1623 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 		 316 aa  48.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1229 aa  48.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.35 
 
 		 1454 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1367 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  26.46 
 
 		 681 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  18.2 
 
 		 1760 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.36 
 
 		 1262 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.01 
 
 		 1267 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.86 
 
 		 1398 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.25 
 
 		 1547 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 		 344 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  27.37 
 
 		 332 aa  46.2  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.62 
 
 		 1617 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.48 
 
 		 1213 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  21.23 
 
 		 1656 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  27.56 
 
 		 578 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  23.99 
 
 		 316 aa  45.8  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.44 
 
 		 1330 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.55 
 
 		 1242 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.84 
 
 		 1357 aa  45.8  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  32 
 
 		 589 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 		 316 aa  44.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  19.81 
 
 		 505 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 1334 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 897 aa  44.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 		 317 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>