More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4246 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 958 aa  1910    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.89 
 
 		 919 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.2 
 
 		 1334 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.5 
 
 		 924 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1265 aa  106  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.37 
 
 		 1163 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.88 
 
 		 943 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 		 1344 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.81 
 
 		 1363 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.65 
 
 		 1161 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.86 
 
 		 1357 aa  83.2  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1196 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.65 
 
 		 1161 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 		 1193 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.41 
 
 		 947 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  20.35 
 
 		 1348 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35 
 
 		 865 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.37 
 
 		 1656 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.65 
 
 		 1217 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  41.75 
 
 		 973 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  32.29 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.85 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.16 
 
 		 1481 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  19.21 
 
 		 1188 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.29 
 
 		 1364 aa  75.1  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.86 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  45.98 
 
 		 780 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.79 
 
 		 576 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.83 
 
 		 696 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 1557 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.37 
 
 		 737 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  52.44 
 
 		 1214 aa  72.8  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  34.95 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.77 
 
 		 1240 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.25 
 
 		 642 aa  72  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  40.95 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 		 954 aa  71.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.86 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  21.25 
 
 		 1016 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.57 
 
 		 1711 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  35.9 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.3 
 
 		 675 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.65 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.15 
 
 		 1684 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  21.14 
 
 		 1016 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40.95 
 
 		 1510 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.51 
 
 		 1686 aa  69.3  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  40.82 
 
 		 1807 aa  68.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.4 
 
 		 1652 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  50 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35.82 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29 
 
 		 1553 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1401 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  52.78 
 
 		 872 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  47.95 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 1221 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.89 
 
 		 1262 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  50.56 
 
 		 540 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  42.05 
 
 		 1188 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  21.9 
 
 		 687 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.25 
 
 		 677 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.57 
 
 		 729 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  47.22 
 
 		 1789 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.31 
 
 		 1523 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1229 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 		 1236 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.28 
 
 		 1760 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1477 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  40.4 
 
 		 840 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.53 
 
 		 1454 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  36.73 
 
 		 1164 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  46.58 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  43.9 
 
 		 1209 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1661 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  44.12 
 
 		 1552 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 		 1878 aa  65.1  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  40.21 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.18 
 
 		 1208 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.36 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.59 
 
 		 1004 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 		 1247 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  32.98 
 
 		 778 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.88 
 
 		 833 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.39 
 
 		 630 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  40.24 
 
 		 1097 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.58 
 
 		 608 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1213 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.31 
 
 		 1242 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  23.69 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.21 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.16 
 
 		 1256 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  23.69 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  37.29 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.28 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1474 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.08 
 
 		 1190 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  43 
 
 		 1766 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  43.66 
 
 		 1714 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 		 443 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>