More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5411 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
719 aa  1460    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
1043 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 
584 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  34.33 
 
 
922 aa  114  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
639 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
639 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
625 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  30.14 
 
 
929 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 
254 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
617 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 
925 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  29.24 
 
 
348 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.19 
 
 
282 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.41 
 
 
416 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 
346 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
620 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.5 
 
 
527 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  33.72 
 
 
740 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.69 
 
 
475 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.03 
 
 
820 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  36.67 
 
 
348 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  29.92 
 
 
358 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.27 
 
 
1911 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.49 
 
 
781 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.25 
 
 
390 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  32.25 
 
 
862 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 
351 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  28.91 
 
 
288 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
654 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.69 
 
 
446 aa  101  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
623 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
618 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  34.76 
 
 
973 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
637 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  31.58 
 
 
664 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
637 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
715 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.45 
 
 
338 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  30.71 
 
 
892 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
882 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.19 
 
 
636 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.56 
 
 
287 aa  97.8  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  28.12 
 
 
611 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  33.66 
 
 
603 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  31.44 
 
 
296 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 
398 aa  95.9  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  28.9 
 
 
262 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.57 
 
 
919 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
621 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  31.46 
 
 
877 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.35 
 
 
802 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
276 aa  94  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  29.04 
 
 
269 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.35 
 
 
554 aa  94  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  28.84 
 
 
287 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
616 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  29.91 
 
 
281 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
593 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  26.74 
 
 
1104 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  30.04 
 
 
522 aa  91.3  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  27.49 
 
 
323 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.04 
 
 
398 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
538 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 
267 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.64 
 
 
952 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  29.13 
 
 
426 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  29.41 
 
 
305 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  27.69 
 
 
267 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.92 
 
 
587 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  29.48 
 
 
285 aa  87.8  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 
433 aa  87  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.12 
 
 
291 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  29.27 
 
 
620 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
555 aa  87  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.83 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 
768 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.32 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  30.26 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28.92 
 
 
1196 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  30.4 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  26.89 
 
 
292 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  26.89 
 
 
292 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.41 
 
 
692 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
509 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  27.73 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 
263 aa  82  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.4 
 
 
924 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.54 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.9 
 
 
829 aa  81.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  29.96 
 
 
523 aa  80.9  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  26.25 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  28.12 
 
 
586 aa  80.9  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.36 
 
 
586 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
698 aa  79.7  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.95 
 
 
751 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 
657 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.72 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  26.74 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>