65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1241 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1366 aa  2808    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1082 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  23.82 
 
 
1087 aa  292  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.01 
 
 
1611 aa  140  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1799  hypothetical protein  25.5 
 
 
1241 aa  112  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  47.96 
 
 
1416 aa  99  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.96 
 
 
782 aa  95.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.9 
 
 
730 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 
817 aa  82  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.62 
 
 
2145 aa  81.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20.13 
 
 
1313 aa  65.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.92 
 
 
825 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  19.28 
 
 
732 aa  63.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.32 
 
 
1550 aa  62.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
1060 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.76 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
567 aa  58.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 
991 aa  57  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
1180 aa  55.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.5 
 
 
1676 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
809 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  22.34 
 
 
708 aa  54.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  30.53 
 
 
646 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.59 
 
 
1404 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 
985 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  19.3 
 
 
1119 aa  53.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.26 
 
 
767 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 
1162 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  22.9 
 
 
757 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 
1186 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.29 
 
 
1212 aa  51.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  19.32 
 
 
1526 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.75 
 
 
2413 aa  50.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
568 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
1162 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  21.71 
 
 
828 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 
568 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25 
 
 
672 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 
1285 aa  50.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
718 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 
454 aa  49.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 
650 aa  49.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
693 aa  49.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
827 aa  48.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.28 
 
 
1288 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  19.09 
 
 
1040 aa  47.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
3145 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
949 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  20.75 
 
 
836 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  20.41 
 
 
1215 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  21.66 
 
 
1328 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
833 aa  47.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 
957 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
714 aa  47.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
924 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
857 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  18.53 
 
 
1911 aa  47.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  21.53 
 
 
936 aa  47  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 
771 aa  46.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.49 
 
 
1238 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  20.18 
 
 
799 aa  45.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.39 
 
 
681 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.73 
 
 
3172 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
923 aa  45.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.09 
 
 
816 aa  45.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>