46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0873 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1167    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.91 
 
 		 730 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  54.6 
 
 		 817 aa  349  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1082 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1087 aa  107  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.64 
 
 		 1611 aa  97.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1238 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  22.39 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1123 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  18.95 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.36 
 
 		 782 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.49 
 
 		 2145 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1550 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1366 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 		 991 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  29.01 
 
 		 364 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  28.43 
 
 		 830 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 		 828 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.95 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 949 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  24.39 
 
 		 711 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.81 
 
 		 985 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 		 1266 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 945 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1404 aa  50.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1212 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.32 
 
 		 1147 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.66 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  20.39 
 
 		 1519 aa  47.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 361 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 847 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.87 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.82 
 
 		 1009 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 1154 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  36.71 
 
 		 836 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1261 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.15 
 
 		 852 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 373 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24 
 
 		 689 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 854 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 611 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 635 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 635 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.56 
 
 		 971 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>