34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3448 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1719    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 		 2741 aa  114  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 2741 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.59 
 
 		 1162 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1162 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.88 
 
 		 893 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 916 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 854 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  25.62 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.19 
 
 		 991 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.84 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  26.07 
 
 		 989 aa  54.7  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.39 
 
 		 1009 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 809 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 		 968 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.93 
 
 		 853 aa  52  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1215 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 883 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 937 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  22.45 
 
 		 919 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1054 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 854 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  21.8 
 
 		 903 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  30.48 
 
 		 950 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  30.48 
 
 		 950 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 851 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  30.7 
 
 		 960 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 822 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>