87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1144 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  100 
 
 
391 aa  786    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.86 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
963 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
795 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.52 
 
 
616 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.67 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
652 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  26.25 
 
 
454 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  30.61 
 
 
463 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 
450 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.63 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.89 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  25.83 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  26.48 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  32 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  20.87 
 
 
611 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.62 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.99 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  31.13 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  32.65 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.02 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  32.88 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  23.93 
 
 
484 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.46 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.06 
 
 
774 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 
687 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.77 
 
 
365 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25 
 
 
653 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.62 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.51 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.09 
 
 
901 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.25 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 
457 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  25.12 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 
469 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
861 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  28.68 
 
 
416 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.74 
 
 
380 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.5 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  22.83 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 
612 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  22.41 
 
 
2122 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 
1454 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  32.76 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1803  Pyrrolo-quinoline quinone  23.92 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.325377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  30.53 
 
 
726 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.2 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.34 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.12 
 
 
386 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.25 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.6 
 
 
1328 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
705 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.77 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  31.45 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.65 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.4 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.98 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.45 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.65 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  19.09 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  33.08 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.42 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
447 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 
611 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.94 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.9 
 
 
809 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25.36 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.94 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.73 
 
 
444 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>