63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1500 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1500  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
407 aa  811    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0717216  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2689  Pyrrolo-quinoline quinone  26.85 
 
 
392 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.02 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.16 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
963 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 
475 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  28.85 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  22.44 
 
 
2122 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.67 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.81 
 
 
901 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.35 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 
451 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.91 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
531 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.91 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.01 
 
 
809 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  36.43 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.95 
 
 
450 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.34 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  34.62 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  30.15 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.99 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.98 
 
 
1682 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.91 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  24.77 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  23.42 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
454 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.65 
 
 
469 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 
471 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
705 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  40.79 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  24.86 
 
 
637 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  40.79 
 
 
448 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  40.98 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
1454 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 
795 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  29.49 
 
 
486 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  32.61 
 
 
581 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  27.66 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.81 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  31.63 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  30.22 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.61 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  26.36 
 
 
444 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.08 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  30.95 
 
 
797 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  27.82 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  27.43 
 
 
1812 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.61 
 
 
457 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 
392 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  30.94 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.31 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>