23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0883 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
442 aa  892    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.68 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  37.78 
 
 
1454 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
324 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  21.65 
 
 
322 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.91 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 
797 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  21.21 
 
 
322 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.05 
 
 
557 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  27.87 
 
 
531 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  22.55 
 
 
1682 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  35.51 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 
546 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.22 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1394  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 
471 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  26.87 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>