130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1219 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
603 aa  1218    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  97.01 
 
 
603 aa  1152    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
652 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
687 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.54 
 
 
653 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 
322 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.79 
 
 
2122 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.8 
 
 
324 aa  98.2  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 
322 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.3 
 
 
1682 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 
322 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 
431 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
546 aa  86.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.3 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
774 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  29.05 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.34 
 
 
1812 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  36.09 
 
 
613 aa  81.3  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  23.6 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  25.68 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.19 
 
 
795 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
445 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.26 
 
 
1454 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  22.28 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.85 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 
611 aa  67  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25 
 
 
616 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 
705 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.74 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 
643 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 
383 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  24.43 
 
 
487 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  21.55 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  21.55 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
861 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.65 
 
 
556 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 
386 aa  57.4  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 
441 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.08 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 
365 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  21.45 
 
 
373 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 
963 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 
382 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  23.14 
 
 
534 aa  54.3  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  23.81 
 
 
2036 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.17 
 
 
395 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.51 
 
 
611 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  23.81 
 
 
1969 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 
389 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  24.64 
 
 
408 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.94 
 
 
391 aa  51.6  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  25.3 
 
 
645 aa  51.2  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.03 
 
 
392 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.03 
 
 
392 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.03 
 
 
392 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.03 
 
 
392 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.51 
 
 
411 aa  50.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  23.17 
 
 
439 aa  50.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.26 
 
 
797 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  22.58 
 
 
363 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.63 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.66 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.58 
 
 
363 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.66 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  31.13 
 
 
371 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 
379 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.85 
 
 
834 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.44 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.27 
 
 
384 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.27 
 
 
384 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.27 
 
 
386 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  23.88 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  21.3 
 
 
407 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.53 
 
 
395 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.02 
 
 
395 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  31.13 
 
 
371 aa  47.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.58 
 
 
392 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.38 
 
 
380 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  23.68 
 
 
387 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  19.85 
 
 
434 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  22.14 
 
 
611 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.62 
 
 
438 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 
372 aa  47.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  28.08 
 
 
392 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.08 
 
 
392 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  20.05 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  22.82 
 
 
2272 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 
454 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  26.75 
 
 
606 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.08 
 
 
392 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.08 
 
 
392 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.77 
 
 
393 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>