40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2376 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 436 aa  900    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  29.79 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  30.17 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  28.28 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  28.61 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  27.19 
 
 		 466 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  26.16 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 		 934 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  24.83 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  27.82 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.92 
 
 		 1812 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  21.95 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.81 
 
 		 2036 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.81 
 
 		 1969 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.45 
 
 		 556 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  32.91 
 
 		 639 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.44 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2638  Pyrrolo-quinoline quinone  27.45 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.07 
 
 		 797 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  38.46 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  38.46 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  20.9 
 
 		 593 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  22.37 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.86 
 
 		 1328 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  23.74 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 795 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.06 
 
 		 653 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 652 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.1 
 
 		 687 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>