102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0137 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
481 aa  954    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  26.21 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  31.96 
 
 
499 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  31.96 
 
 
499 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 
536 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.05 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.46 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  28.71 
 
 
463 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 
514 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.42 
 
 
384 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.12 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 
1454 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 
475 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  22.62 
 
 
901 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 
352 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.73 
 
 
392 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 
432 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.73 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.73 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.73 
 
 
392 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.73 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
795 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.65 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.92 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.41 
 
 
653 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  28.24 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27 
 
 
652 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.3 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.83 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 
381 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  21.82 
 
 
556 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.71 
 
 
616 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  22.13 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.3 
 
 
395 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 
420 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.3 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
395 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  22.18 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  23.55 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.42 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  23.55 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  22.11 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  25.84 
 
 
1311 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.6 
 
 
392 aa  50.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 
392 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 
374 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.19 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  23.11 
 
 
1067 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  21.7 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  21.66 
 
 
687 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.19 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.61 
 
 
396 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 
963 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.72 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  25.35 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  25.36 
 
 
450 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  21.72 
 
 
774 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.97 
 
 
393 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 
705 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 
393 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  25.37 
 
 
497 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  22.52 
 
 
455 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  21.63 
 
 
448 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 
395 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 
395 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.7 
 
 
1842 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 
797 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.08 
 
 
1812 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  21.61 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.01 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.49 
 
 
395 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  21.97 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.61 
 
 
371 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  23.89 
 
 
618 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.19 
 
 
386 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.61 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  26.99 
 
 
322 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
395 aa  43.5  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  21.45 
 
 
809 aa  43.5  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.59 
 
 
395 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.59 
 
 
395 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>